Acidul 3-indoleacetic este un fel de auxină vegetală. Auxina are multe efecte fiziologice, care sunt legate de concentrația sa. Concentrația scăzută poate favoriza creșterea, iar concentrația ridicată va inhiba creșterea, chiar ucid plantele. Acest efect inhibitor este legat de faptul dacă poate induce formarea etilenei. Efectele fiziologice ale auxinei se manifestă pe două niveluri. La nivel celular, auxina poate stimula diviziunea celulelor cambium; stimulează alungirea ramurilor și inhibă creșterea celulelor rădăcinii; promovează diferențierea celulelor xilemice și floemice, promovează rădăcinile butașilor și reglează morfologia calusului. La nivelul organelor și al întregii plante, auxina funcționează de la răsad până la coacerea fructelor. Auxina controlează inhibarea reversibilă a luminii roșii a alungirii hipocotilului la răsaduri; atunci când se transferă pe partea inferioară a lăstarilor, produce geotropism ramificat; atunci când se transferă în partea de fundal a lăstarilor, produce fototropism ramificat; Acidul 3-indoleacetic produce un avantaj apical și întârzie senescența frunzelor. Auxina favorizează înflorirea, induce dezvoltarea fructelor partenocarpice și întârzie maturitatea fructelor.